Le budget alloué à la santé par le pays représente 8,8 % en 1990 et redescend à 6,8 % en 1999. On est de plus en plus loin des 10 % recommandés par l'OMS. A ce faible budget il faut ajouter le problème lié aux décaissements effectifs pour la réalisation des activités programmées. 80 % de ce budget est destiné au paiement des salaires des personnels de santé.